Ο θεματικός στόχος του ΚΕ.Κ.Π.Α. είναι η ενίσχυση της Έρευνας, της Τεχνολογικής Ανάπτυξης και της Καινοτομίας με επενδυτική προτεραιότητα την ενδυνάμωση των υποδομών Έρευνας & Καινοτομίας (Ε&Κ) στην Περιφέρεια Αττικής, των κινήτρων ανάπτυξης αριστείας στον τομέα Ε&Κ και την προώθηση της λειτουργίας Κέντρων Αριστείας (ΚΑ), ιδίως των ΚΑ ευρωπαϊκού ενδιαφέροντος.
